在飞地经济合作协议中，如何约定飞地经济合作项目的保密事项通常需要按照以下方式进行：

1.明确约定保密事项：明确约定保密事项，包括飞地经济合作项目的机密信息、保密义务、保密期限、保密方式等方面的内容，以及各方在合作中应享有的保密事项等。

2.列出具体的保密事项：明确约定具体保密事项，包括飞地经济合作项目的机密信息、保密义务、保密期限、保密方式等方面的内容，以及各方在合作中应享有的具体保密事项等。

3.进行详细的解释：明确约定详细的保密事项，包括对保密信息的保密义务、保密期限、保密方式等方面进行详细的解释说明，包括对保密信息的收集、处理、存储、传输等方面的内容，以及各方在合作中应享有的具体保密事项等进行详细的解释说明。

4.确定具体的保密期限：明确约定具体的保密期限，包括保密信息的保密期限、保密期限的起止时间等方面的内容，以及各方在合作中应享有的具体保密期限等。

5.确定具体的保密方式：明确约定具体的保密方式，包括对飞地经济合作项目的机密信息采取的保密方式、保密措施等方面的内容，以及各方在合作中应享有的具体保密方式等。

总之，飞地经济合作协议中需要明确约定保密事项、具体的保密事项、保密期限、保密方式等方面的内容，以确保各方在合作中能够合理约定保密事项，避免不必要的保密事项争议和泄露争议。