在飞地经济合作协议中，如何确定飞地经济合作项目的土地使用权通常需要按照以下方式进行：

1.明确约定土地使用权的归属：明确约定土地使用权的归属，包括土地使用权的种类、使用权的范围、使用权的期限等方面的内容，以及各方在合作中应享有的土地使用权等。

2.列出具体的土地使用权范围：明确约定具体土地使用权范围，包括土地使用权的地域范围、土地用途、土地利用现状、土地权利状况等方面的内容，以及各方在合作中应享有的具体土地使用权范围等。

3.进行详细的解释：明确约定详细的土地使用权范围，包括对土地使用权的范围、范围的具体描述、土地使用权的具体用途等方面的内容，以及各方在合作中应享有的具体土地使用权范围等进行详细的解释说明。

4.确定具体的土地使用权期限：明确约定具体的土地使用权期限，包括土地使用权的起始时间、终止时间、续展期限等方面的内容，以及各方在合作中应享有的具体土地使用权期限等。

5.进行风险的约定：明确约定合作中可能面临的风险，包括土地使用权的风险、法律风险、合作中可能面临的风险等方面的内容，以及各方在合作中应承担的风险等。

总之，飞地经济合作协议中需要明确约定土地使用权的归属、具体的土地使用权范围、土地使用权期限、土地使用权风险等方面的内容，以确保各方在合作中能够合理约定土地使用权，避免不必要的土地使用权争议和损失。