在飞地经济合作协议中，如何约定各方的权利和义务通常需要按照以下方式进行：

1.明确约定各方的权利和义务：明确约定各方的权利和义务，包括各方在飞地经济领域中的自主权、合作权、知情权、决策权、执行权等方面的内容，以及各方在合作中的职责、义务和享有的权益等。

2.确定各方的责任和义务：明确约定各方的责任和义务，包括各方在合作中的职责、任务和目标等方面的内容，以及各方在合作中应承担的义务和承担责任的方式等。

3.明确约定各方的违约责任：明确约定各方的违约责任，包括对违反合作协议的约定造成对方损失的赔偿、对损害飞地地区利益的约定的处罚等方面的内容，以及各方应对违约责任的处理方式等。

4.确定各方的知识产权保护：明确约定各方的知识产权保护，包括对飞地地区的发明创造、商业秘密等方面的知识产权保护等方面的内容，以及各方在合作中应对知识产权的保护方式和措施等。

5.确定各方的争议解决方式：明确约定各方的争议解决方式，包括调解、仲裁、诉讼等方面的内容，以确保各方在合作中能够合理解决争议。

总之，飞地经济合作协议中需要明确约定各方的权利和义务、责任和义务、知识产权保护、争议解决方式等方面的内容，以确保各方在合作中能够合理承担权利和义务，保护各方的合法权益。